Programa
SG8: CROMOSOMOPATÍAS I TECNICAS DE CITOGENETICA CLASICA Y MOLECULAR El cariotipo
humano. Nomenclatura. Revisión del concepto de cromosoma. Cromosomas, estados de la
cromatina y ciclo celular. Tipos de cromosomas: metacéntricos; submetacéntricos y
acrocéntricos. Estudios del material cromosómico: utilidad y fundamentos de las técnicas de
citogenética clásica y molecular: Cariotipo con bandeo G; Cariotipo de alta resolución; FISH
(Hibridación in situ y fluorescencia); Micromatrices de ADN (CGH‐arrays); MLPA (multiplex
ligation-dependent probe amplification). Clasificación de las anomalías cromosómicas:
numéricas y estructurales.
Técnicas 2
- Permiten el estudio y función de los cromosomas
- Número y estructura de los cromosomas
Se tratará el cómo funciona cada técnica y bajo qué condiciones se ocupa la misma
Cariotipo: principal técnica de estudio en citogenética
- Fundamental: gracias a esta técnica, se funda el campo de la citogenética
- Antes de 1956 no sabía el número de cromosomas en humanos
- 1959 : en tres cortos años, ya se identifica el síndrome de Down como una cromosopatia
- Se logran ver cromosomas en estado condensado
Pasos:
1.-Muestra de sangre
2.-Se centrifuga, se separan eritrocitos-glóbulos blancos-etc
3.-Se toman leucocitos en G0
4.-Se incuban para que entren en mitosis, donde se condensa el material genético
5.-Solo algunos tienen su ADN condensado ¿cómo hacer para sincronizarlos? Se utiliza colchicina, que impide la formación de microtubulos, por ende, los cromosomas no podrán segregarse
6.-La anafase no puede ocurrir gracias a la colchicina, sincronizándose los cromosomas en metafase
7.-Se explotan las células, y se cuenta el número de cromosomas
8.-Para poder realizar la visualización se utilizan colorante de Hensen, que tiñe cada cromosoma en diferentes colores
9.-Se obtiene el cariograma
- Gracias a esta técnica se pueden observar cromosopatías en desarrollos embrionarios, sin afectar al embrión.
- La técnica, no es rápida. Requiere de alrededor de diez para que se cultiven las células
¿Qué anomalías se logran ver con esta técnica?
- Numéricas: síndrome de Down, Turner, Patau, Edwards
- Estructurales: tienen que superar las 5 millones de bases para poder visualizarse
- Inversiones cromosómicas
- Translocaciones: intercambio de ADN entre cromosomas no homólogos
¿Se devela todo entonces?
- Existe un número mínimo de alteraciones de pb (5MB) para que se puedan visualizar
- Hay variaciones de mayor resolución -> Cariotipo de alta resolución
- El cariotipo de alta resolución -> se detectan anomalías desde los 2MB
- En conclusión, las alteración que se pueden dilucidar gracias al cariotipo tienen que ser enormes
¿Cómo resolver este dilema? -> Técnica de FISH
- Aumenta el grado de observación
- Límite: 100.000 pb -> claramente menor a las técnicas de cariotipo
¿Cómo funciona?
- Fragmentos de ADN complementario a aquella región que quiero identificar
- Se marcan con fluróforos, hibridándose a nuestra muestra biológica
Pasos:
1.-Se detecta secuencia de ADN a estudiar
2.-Se crea sonda de ADN complementario
3.-Se marca sonda con fluróforo
4.-Se hibrida ADN a sonda marcada
5.-Se observa fluorescencia
Sólo se ve, en consecuencia, la fluorescencia emitida por la sonda, es una técnica sesgada. Usándose bajo cierta sospecha del clínico de poseer cierta anomalía
Ambas, cariotipo y FISH, se suelen solicitar en conjunto, siendo FISH mucho más rápida
Técnica de CGH-Array/CGH-Comparativo
- Permite ver desbalances muy pequeños, de hasta 1.000 pares de bases
- Se fundamenta en comparar un ADN control con el de un paciente
1.-Extraemos ambos ADN
2.-Se fragmenta el ADN mecánicamente
3.-Al control se le agrega un fluoróforo distinto al del paciente
4.-Se intentan complementar ambas porciones del ADN, donde todas las posiciones del ADN están representadas
5.-Se expresa ADN dando un color que proviene de la combinación de ambos fluróforo:
- Donde hay predominancia del color control: deleción
- Donde hay predominancia del color paciente: duplicación
- Donde no predomina ninguno de los dos colores: igual carga genética control/paciente
Polimorfismos: los individuos varían entre sí en si ADN, pero es totalmente normal, no patológico. CGH-comparativo puede ayudar a evidenciar estos polimorfismos. Se deberá observar si tal variante es patológica: existen alrededor de 24.000 variantes de alrededor de 1.000 pb que no representan ninguna patología
Variante de CGH-comparativos -> MLPA
- Menos potente que el CGH
- Sigue comparando dos ADN
- Mucho más barata -> llevándose su uso al aspecto clínico
- 50 a 60 porciones del genoma -> se generan sondas, claramente de diferente tamaño
Pasos:
1.-Se desnaturaliza el ADN por calor
2.-Se une sonda por complementariedad de bases
3.-Se purifica preparado, quitando sondas que no se hayan unido
4.-Para detectar sondas unidas se aplica una PCR, aumentando de manera exponencial el material genético que se podrá visualizar a medida que ocurre cada ciclo
5.-Mediante un análisis de fragmentos y aprovechando la diferencia de tamaños (electroforesis) de cada una de las sondas, se podrán detectar alteraciones
6.-Se compara con individuos controles (puede ser 1)
Esta técnica, es muy precisa. No se compara absolutamente todo el ADN, sino regiones bastante específicas del mismo. Requiere de una sospecha clínica previa